Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HFEQ30201 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HFEQ30201 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HFEQ30201 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HFEQ30201 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HFEQ30201 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HFEQ30201 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HFEQ30201 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HFEQ30201 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HFEQ30201 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HFEQ30201 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HFEQ30201 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HFEQ30201 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HFEQ30201 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HFEQ30201 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HFEQ30201 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HFEQ30201 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HFEQ30201 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HFEQ30201 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HFEQ30201 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HFEQ30201 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HFEQ30201 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HFEQ30201 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HFEQ30201 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HFEQ30201 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HFEQ30201 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HFEQ30201 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HFEQ30201 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HFEQ30201 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HFEQ30201 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HFEQ30201 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HFEQ30201 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HFEQ30201 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HFEQ30201 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HFEQ30201 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HFEQ30201 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HFEQ30201 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HFEQ30201 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HFEQ30201 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HFEQ30201 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HFEQ30201 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HFEQ30201 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HFEQ30201 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HFEQ30201 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HFEQ30201 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HFEQ30201 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HFEQ30201 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HFEQ30201 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HFEQ30201 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HFEQ30201 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HFEQ30201 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HFEQ30201 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HFEQ30201 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HFEQ30201 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HFEQ30201 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HFEQ30201 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HFEQ30201 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HFEQ30201 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HFEQ30201 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HFEQ30201 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HFEQ30201 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HFEQ30201 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HFEQ30201 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HFEQ30201 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HFEQ30201 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HFEQ30201 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HFEQ30201 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HFEQ30201 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HFEQ30201 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HFEQ30201 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HFEQ30201 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HFEQ30201 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HFEQ30201 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HFEQ30201 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HFEQ30201 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HFEQ30201 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HFEQ30201 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HFEQ30201 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HFEQ30201 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HFEQ30201 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HFEQ30201 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HFEQ30201 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HFEQ30201 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HFEQ30201 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HFEQ30201 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HFEQ30201 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HFEQ30201 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HFEQ30201 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HFEQ30201 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HFEQ30201 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HFEQ30201 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HFEQ30201 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HFEQ30201 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HFEQ30201 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HFEQ30201 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HFEQ30201 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HFEQ30201 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HFEQ30201 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HFEQ30201 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HFEQ30201 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms