Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SKOR2Q2VWA4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SKOR2Q2VWA4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SKOR2Q2VWA4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SKOR2Q2VWA4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKOR2Q2VWA4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SKOR2Q2VWA4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
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