Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MICAQ29983 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MICAQ29983 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MICAQ29983 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MICAQ29983 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MICAQ29983 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MICAQ29983 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MICAQ29983 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MICAQ29983 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MICAQ29983 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MICAQ29983 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MICAQ29983 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MICAQ29983 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MICAQ29983 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MICAQ29983 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MICAQ29983 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MICAQ29983 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MICAQ29983 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MICAQ29983 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MICAQ29983 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MICAQ29983 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MICAQ29983 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MICAQ29983 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MICAQ29983 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICAQ29983 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MICAQ29983 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICAQ29983 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICAQ29983 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICAQ29983 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICAQ29983 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICAQ29983 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICAQ29983 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICAQ29983 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MICAQ29983 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MICAQ29983 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICAQ29983 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MICAQ29983 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MICAQ29983 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICAQ29983 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICAQ29983 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICAQ29983 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICAQ29983 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MICAQ29983 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MICAQ29983 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MICAQ29983 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MICAQ29983 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MICAQ29983 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MICAQ29983 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MICAQ29983 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MICAQ29983 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MICAQ29983 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MICAQ29983 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MICAQ29983 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MICAQ29983 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MICAQ29983 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAQ29983 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAQ29983 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAQ29983 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MICAQ29983 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAQ29983 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAQ29983 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAQ29983 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAQ29983 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAQ29983 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAQ29983 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAQ29983 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MICAQ29983 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAQ29983 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAQ29983 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAQ29983 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAQ29983 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAQ29983 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAQ29983 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MICAQ29983 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAQ29983 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAQ29983 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MICAQ29983 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAQ29983 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAQ29983 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAQ29983 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MICAQ29983 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAQ29983 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAQ29983 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAQ29983 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAQ29983 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAQ29983 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MICAQ29983 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAQ29983 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAQ29983 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAQ29983 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAQ29983 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MICAQ29983 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MICAQ29983 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MICAQ29983 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MICAQ29983 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICAQ29983 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICAQ29983 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICAQ29983 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICAQ29983 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MICAQ29983 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms