Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CSPP1Q1MSJ5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSPP1Q1MSJ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSPP1Q1MSJ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSPP1Q1MSJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.7 ms