Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LONRF1Q17RB8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LONRF1Q17RB8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LONRF1Q17RB8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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