Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRNQ16849 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPRNQ16849 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRNQ16849 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRNQ16849 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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