Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PTPROQ16827 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPROQ16827 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPROQ16827 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPROQ16827 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
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