Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CA9Q16790 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA9Q16790 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA9Q16790 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA9Q16790 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CA9Q16790 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA9Q16790 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA9Q16790 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CA9Q16790 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA9Q16790 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CA9Q16790 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA9Q16790 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA9Q16790 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA9Q16790 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA9Q16790 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CA9Q16790 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CA9Q16790 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CA9Q16790 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CA9Q16790 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CA9Q16790 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CA9Q16790 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA9Q16790 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA9Q16790 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CA9Q16790 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CA9Q16790 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA9Q16790 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA9Q16790 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA9Q16790 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA9Q16790 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA9Q16790 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA9Q16790 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CA9Q16790 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CA9Q16790 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CA9Q16790 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CA9Q16790 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CA9Q16790 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CA9Q16790 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CA9Q16790 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CA9Q16790 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA9Q16790 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA9Q16790 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA9Q16790 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA9Q16790 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA9Q16790 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA9Q16790 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CA9Q16790 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CA9Q16790 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CA9Q16790 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CA9Q16790 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CA9Q16790 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
CA9Q16790 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CA9Q16790 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CA9Q16790 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CA9Q16790 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CA9Q16790 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CA9Q16790 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CA9Q16790 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CA9Q16790 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CA9Q16790 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CA9Q16790 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CA9Q16790 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA9Q16790 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA9Q16790 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CA9Q16790 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA9Q16790 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CA9Q16790 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CA9Q16790 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CA9Q16790 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA9Q16790 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA9Q16790 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA9Q16790 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA9Q16790 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CA9Q16790 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA9Q16790 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA9Q16790 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA9Q16790 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA9Q16790 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA9Q16790 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA9Q16790 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CA9Q16790 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA9Q16790 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CA9Q16790 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA9Q16790 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA9Q16790 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CA9Q16790 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CA9Q16790 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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