Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACKR1Q16570 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACKR1Q16570 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACKR1Q16570 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACKR1Q16570 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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