Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP35Q16560 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP35Q16560 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP35Q16560 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP35Q16560 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP35Q16560 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNRNP35Q16560 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SNRNP35Q16560 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SNRNP35Q16560 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNRNP35Q16560 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNRNP35Q16560 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNRNP35Q16560 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
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