Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TNXAQ16473 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TNXAQ16473 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms