Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms