Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCOLCEQ15113 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCOLCEQ15113 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCOLCEQ15113 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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