Protein–RNA interactions for Protein: Q15024

EXOSC7, Exosome complex component RRP42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC7Q15024 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC7Q15024 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC7Q15024 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXOSC7Q15024 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC7Q15024 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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