Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PSMD6Q15008 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD6Q15008 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD6Q15008 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD6Q15008 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
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