Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RFTN1Q14699 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RFTN1Q14699 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFTN1Q14699 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFTN1Q14699 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms