Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF3Q14653 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRF3Q14653 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRF3Q14653 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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