Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM29Q14134 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM29Q14134 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM29Q14134 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM29Q14134 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM29Q14134 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM29Q14134 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM29Q14134 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRIM29Q14134 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIM29Q14134 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIM29Q14134 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
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