Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTB1Q13884 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTB1Q13884 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTB1Q13884 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNTB1Q13884 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTB1Q13884 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTB1Q13884 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTB1Q13884 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTB1Q13884 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNTB1Q13884 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SNTB1Q13884 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNTB1Q13884 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SNTB1Q13884 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms