Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUNX3Q13761 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RUNX3Q13761 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RUNX3Q13761 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUNX3Q13761 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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