Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBA3CQ13748 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBA3CQ13748 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA3CQ13748 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA3CQ13748 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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