Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CUL4BQ13620 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CUL4BQ13620 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CUL4BQ13620 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CUL4BQ13620 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CUL4BQ13620 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CUL4BQ13620 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CUL4BQ13620 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CUL4BQ13620 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4BQ13620 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4BQ13620 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CUL4BQ13620 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CUL4BQ13620 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CUL4BQ13620 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4BQ13620 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4BQ13620 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4BQ13620 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4BQ13620 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4BQ13620 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4BQ13620 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4BQ13620 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CUL4BQ13620 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CUL4BQ13620 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CUL4BQ13620 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CUL4BQ13620 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CUL4BQ13620 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CUL4BQ13620 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CUL4BQ13620 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CUL4BQ13620 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4BQ13620 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4BQ13620 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4BQ13620 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4BQ13620 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4BQ13620 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CUL4BQ13620 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CUL4BQ13620 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CUL4BQ13620 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CUL4BQ13620 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
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