Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXE3Q13461 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
FOXE3Q13461 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
FOXE3Q13461 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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