Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSAMPQ13449 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LSAMPQ13449 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LSAMPQ13449 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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