Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRAF1Q13077 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAF1Q13077 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
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TRAF1Q13077 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAF1Q13077 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAF1Q13077 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
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