Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD4Q12950 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4Q12950 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4Q12950 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4Q12950 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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