Protein–RNA interactions for Protein: Q12016

VPS68, Vacuolar protein sorting-associated protein 68, yeastyeast

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS68Q12016 PRC1YMR297W 1599 nt6.47□□□□□ -1.37
VPS68Q12016 DOT1YDR440W 1749 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 TFG2YGR005C 1203 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 MHT1YLL062C 975 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 TOK1YJL093C 2076 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 ERR1YOR393W 1314 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 ERR2YPL281C 1314 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 MAM3YOL060C 2121 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 CBR1YIL043C 855 nt6.45□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 TSR2YLR435W 618 nt6.45□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YKR018CYKR018C 2178 nt6.45□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YCR041WYCR041W 333 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 URH1YDR400W 1023 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YRB2YIL063C 984 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 MRPL23YOR150W 492 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 PRB1YEL060C 1908 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YHK8YHR048W 1545 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 TUF1YOR187W 1314 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 CDC1YDR182W 1476 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 GAL2YLR081W 1725 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 RRP9YPR137W 1722 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YAR064WYAR064W 300 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 ATP10YLR393W 840 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YMR122CYMR122C 375 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YBR027CYBR027C 333 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 SEC24YIL109C 2781 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YDL177CYDL177C 513 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YSC83YHR017W 1158 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 TDH2YJR009C 999 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YKR045CYKR045C 552 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YLR463CYLR463C 552 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 AIM34YMR003W 597 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 SNT309YPR101W 528 nt6.42□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 PPM2YOL141W 2088 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YDR187CYDR187C 519 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 SNF4YGL115W 969 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 CEM1YER061C 1329 nt6.41□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YHR020WYHR020W 2067 nt6.4□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 YLR112WYLR112W 420 nt6.4□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 TAE1YBR261C 699 nt6.4□□□□□ -1.38
VPS68Q12016 UIP5YKR044W 1332 nt6.4□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 GPD2YOL059W 1323 nt6.4□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 COQ1YBR003W 1422 nt6.4□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 TOD6YBL054W 1578 nt6.4□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 AMN1YBR158W 1650 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 ITR1YDR497C 1755 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 MRPL28YDR462W 444 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 TRS31YDR472W 852 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 CUP2YGL166W 678 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 COX10YPL172C 1389 nt6.39□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 ATG36YJL185C 882 nt6.38□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 PAC2YER007W 1557 nt6.38□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 YDR387CYDR387C 1668 nt6.38□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 ZWF1YNL241C 1518 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 VMA3YEL027W 483 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 AIM2YAL049C 741 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 FSF1YOR271C 984 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 RFC1YOR217W 2586 nt6.37□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 CHA1YCL064C 1083 nt6.36□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 MTR3YGR158C 753 nt6.36□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 YML018CYML018C 1182 nt6.36□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 RNH201YNL072W 924 nt6.36□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 BSP1YPR171W 1731 nt6.36□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 DTR1YBR180W 1719 nt6.36□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 YER137CYER137C 447 nt6.35□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 AVO2YMR068W 1281 nt6.35□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 SCS7YMR272C 1155 nt6.35□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 CCT8YJL008C 1707 nt6.35□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 CTF19YPL018W 1110 nt6.34□□□□□ -1.39
VPS68Q12016 MSP1YGR028W 1089 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 RDN5-2RDN5-2 119 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 RDN5-3RDN5-3 119 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 RDN5-4RDN5-4 119 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 RDN5-5RDN5-5 119 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 YMR295CYMR295C 594 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 RFC4YOL094C 972 nt6.33□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.32□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 YOR012WYOR012W 414 nt6.32□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 YMR279CYMR279C 1623 nt6.32□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 PPH22YDL188C 1134 nt6.31□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 RUF23RUF23 254 nt6.31□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 FAL1YDR021W 1200 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 MPC2YHR162W 390 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 LYS1YIR034C 1122 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 QRI5YLR204W 336 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 IRC11YOR013W 471 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 NUP84YDL116W 2181 nt6.3□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 ERS1YCR075C 783 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 STT3YGL022W 2157 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 YJR146WYJR146W 354 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 MCH2YKL221W 1422 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 MRPL10YNL284C 969 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 ARC35YNR035C 1029 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 MSO1YNR049C 633 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 PRY3YJL078C 2646 nt6.29□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.28□□□□□ -1.4
VPS68Q12016 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.5 ms