Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FMODQ06828 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FMODQ06828 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FMODQ06828 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FMODQ06828 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FMODQ06828 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FMODQ06828 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FMODQ06828 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FMODQ06828 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FMODQ06828 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FMODQ06828 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FMODQ06828 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FMODQ06828 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FMODQ06828 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FMODQ06828 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FMODQ06828 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FMODQ06828 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FMODQ06828 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FMODQ06828 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FMODQ06828 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FMODQ06828 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FMODQ06828 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FMODQ06828 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FMODQ06828 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FMODQ06828 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FMODQ06828 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FMODQ06828 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FMODQ06828 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FMODQ06828 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FMODQ06828 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FMODQ06828 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FMODQ06828 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FMODQ06828 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FMODQ06828 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FMODQ06828 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FMODQ06828 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FMODQ06828 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FMODQ06828 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FMODQ06828 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FMODQ06828 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FMODQ06828 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FMODQ06828 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FMODQ06828 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FMODQ06828 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FMODQ06828 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FMODQ06828 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FMODQ06828 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FMODQ06828 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FMODQ06828 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FMODQ06828 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FMODQ06828 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FMODQ06828 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FMODQ06828 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FMODQ06828 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FMODQ06828 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FMODQ06828 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FMODQ06828 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FMODQ06828 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FMODQ06828 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FMODQ06828 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FMODQ06828 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FMODQ06828 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FMODQ06828 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FMODQ06828 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FMODQ06828 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FMODQ06828 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FMODQ06828 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FMODQ06828 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FMODQ06828 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FMODQ06828 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FMODQ06828 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FMODQ06828 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FMODQ06828 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FMODQ06828 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FMODQ06828 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FMODQ06828 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FMODQ06828 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FMODQ06828 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FMODQ06828 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FMODQ06828 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FMODQ06828 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FMODQ06828 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FMODQ06828 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FMODQ06828 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FMODQ06828 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FMODQ06828 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FMODQ06828 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FMODQ06828 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FMODQ06828 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FMODQ06828 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FMODQ06828 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FMODQ06828 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FMODQ06828 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FMODQ06828 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FMODQ06828 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FMODQ06828 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FMODQ06828 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FMODQ06828 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FMODQ06828 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FMODQ06828 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms