Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ROM1Q03395 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ROM1Q03395 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ROM1Q03395 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms