Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX2Q02962 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAX2Q02962 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PAX2Q02962 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms