Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PMP22Q01453 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMP22Q01453 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PMP22Q01453 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMP22Q01453 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms