Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMAD3P84022 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMAD3P84022 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMAD3P84022 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMAD3P84022 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms