Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MRPS25P82663 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MRPS25P82663 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MRPS25P82663 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MRPS25P82663 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MRPS25P82663 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms