Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPS3AP61247 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPS3AP61247 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPS3AP61247 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms