Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BACE1P56817 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BACE1P56817 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BACE1P56817 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BACE1P56817 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BACE1P56817 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BACE1P56817 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BACE1P56817 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BACE1P56817 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BACE1P56817 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BACE1P56817 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BACE1P56817 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BACE1P56817 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BACE1P56817 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BACE1P56817 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BACE1P56817 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BACE1P56817 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BACE1P56817 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BACE1P56817 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BACE1P56817 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BACE1P56817 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BACE1P56817 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BACE1P56817 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BACE1P56817 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BACE1P56817 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BACE1P56817 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BACE1P56817 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BACE1P56817 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BACE1P56817 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BACE1P56817 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BACE1P56817 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BACE1P56817 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BACE1P56817 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BACE1P56817 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BACE1P56817 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BACE1P56817 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BACE1P56817 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BACE1P56817 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BACE1P56817 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BACE1P56817 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BACE1P56817 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BACE1P56817 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BACE1P56817 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BACE1P56817 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BACE1P56817 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BACE1P56817 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BACE1P56817 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BACE1P56817 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BACE1P56817 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BACE1P56817 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BACE1P56817 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BACE1P56817 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BACE1P56817 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BACE1P56817 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BACE1P56817 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BACE1P56817 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BACE1P56817 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BACE1P56817 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BACE1P56817 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BACE1P56817 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BACE1P56817 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BACE1P56817 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BACE1P56817 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BACE1P56817 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BACE1P56817 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BACE1P56817 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BACE1P56817 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BACE1P56817 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BACE1P56817 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BACE1P56817 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BACE1P56817 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BACE1P56817 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BACE1P56817 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BACE1P56817 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BACE1P56817 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BACE1P56817 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
BACE1P56817 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BACE1P56817 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BACE1P56817 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BACE1P56817 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BACE1P56817 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BACE1P56817 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
BACE1P56817 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BACE1P56817 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BACE1P56817 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BACE1P56817 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BACE1P56817 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BACE1P56817 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BACE1P56817 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BACE1P56817 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms