Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLDN8P56748 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN8P56748 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms