Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
BRPF1P55201 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
BRPF1P55201 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
BRPF1P55201 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
BRPF1P55201 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
BRPF1P55201 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 357.5 ms