Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC12A3P55017 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC12A3P55017 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC12A3P55017 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC12A3P55017 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC12A3P55017 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC12A3P55017 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC12A3P55017 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC12A3P55017 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC12A3P55017 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC12A3P55017 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC12A3P55017 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC12A3P55017 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC12A3P55017 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC12A3P55017 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC12A3P55017 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC12A3P55017 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC12A3P55017 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC12A3P55017 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC12A3P55017 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC12A3P55017 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC12A3P55017 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC12A3P55017 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC12A3P55017 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC12A3P55017 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SLC12A3P55017 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC12A3P55017 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC12A3P55017 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms