Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EPHB4P54760 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EPHB4P54760 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPHB4P54760 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
EPHB4P54760 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPHB4P54760 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.6 ms