Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RAD23BP54727 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD23BP54727 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD23BP54727 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RAD23BP54727 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms