Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS2P54278 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS2P54278 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS2P54278 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS2P54278 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS2P54278 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PMS2P54278 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS2P54278 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS2P54278 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS2P54278 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS2P54278 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PMS2P54278 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMS2P54278 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PMS2P54278 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMS2P54278 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMS2P54278 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PMS2P54278 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMS2P54278 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMS2P54278 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMS2P54278 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PMS2P54278 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMS2P54278 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMS2P54278 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMS2P54278 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMS2P54278 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMS2P54278 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMS2P54278 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PMS2P54278 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMS2P54278 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMS2P54278 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMS2P54278 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMS2P54278 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PMS2P54278 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P54278 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P54278 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P54278 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P54278 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P54278 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P54278 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PMS2P54278 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P54278 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P54278 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P54278 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P54278 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P54278 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P54278 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P54278 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P54278 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PMS2P54278 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMS2P54278 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMS2P54278 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMS2P54278 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PMS2P54278 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMS2P54278 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PMS2P54278 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMS2P54278 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PMS2P54278 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMS2P54278 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PMS2P54278 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMS2P54278 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMS2P54278 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMS2P54278 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMS2P54278 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PMS2P54278 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMS2P54278 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMS2P54278 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PMS2P54278 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PMS2P54278 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMS2P54278 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMS2P54278 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMS2P54278 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PMS2P54278 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PMS2P54278 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMS2P54278 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMS2P54278 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMS2P54278 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMS2P54278 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PMS2P54278 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS2P54278 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS2P54278 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS2P54278 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PMS2P54278 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS2P54278 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS2P54278 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS2P54278 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS2P54278 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS2P54278 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PMS2P54278 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS2P54278 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS2P54278 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS2P54278 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMS2P54278 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P54278 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P54278 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P54278 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P54278 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P54278 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P54278 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS2P54278 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS2P54278 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms