Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2KP53803 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLR2KP53803 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POLR2KP53803 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms