Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOSBP53539 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOSBP53539 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOSBP53539 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOSBP53539 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOSBP53539 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOSBP53539 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOSBP53539 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOSBP53539 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
FOSBP53539 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOSBP53539 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOSBP53539 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FOSBP53539 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOSBP53539 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOSBP53539 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOSBP53539 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOSBP53539 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FOSBP53539 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOSBP53539 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOSBP53539 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOSBP53539 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FOSBP53539 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOSBP53539 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOSBP53539 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOSBP53539 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOSBP53539 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOSBP53539 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FOSBP53539 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOSBP53539 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOSBP53539 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOSBP53539 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FOSBP53539 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOSBP53539 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOSBP53539 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FOSBP53539 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FOSBP53539 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOSBP53539 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FOSBP53539 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
FOSBP53539 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FOSBP53539 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOSBP53539 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOSBP53539 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOSBP53539 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOSBP53539 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOSBP53539 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOSBP53539 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOSBP53539 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOSBP53539 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOSBP53539 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOSBP53539 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOSBP53539 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOSBP53539 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOSBP53539 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOSBP53539 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOSBP53539 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOSBP53539 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FOSBP53539 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOSBP53539 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOSBP53539 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOSBP53539 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOSBP53539 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOSBP53539 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOSBP53539 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOSBP53539 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FOSBP53539 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOSBP53539 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FOSBP53539 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
FOSBP53539 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOSBP53539 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOSBP53539 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOSBP53539 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOSBP53539 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOSBP53539 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOSBP53539 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOSBP53539 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOSBP53539 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FOSBP53539 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOSBP53539 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
FOSBP53539 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOSBP53539 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOSBP53539 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOSBP53539 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOSBP53539 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FOSBP53539 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOSBP53539 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOSBP53539 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FOSBP53539 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FOSBP53539 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOSBP53539 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FOSBP53539 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOSBP53539 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOSBP53539 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOSBP53539 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOSBP53539 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOSBP53539 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOSBP53539 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOSBP53539 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOSBP53539 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOSBP53539 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FOSBP53539 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms