Protein–RNA interactions for Protein: P52926

HMGA2, High mobility group protein HMGI-C, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA2P52926 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGA2P52926 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMGA2P52926 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMGA2P52926 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGA2P52926 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms