Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CAPZA1P52907 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPZA1P52907 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPZA1P52907 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPZA1P52907 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPZA1P52907 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA1P52907 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA1P52907 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPZA1P52907 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA1P52907 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA1P52907 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA1P52907 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA1P52907 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA1P52907 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPZA1P52907 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA1P52907 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA1P52907 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA1P52907 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPZA1P52907 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA1P52907 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA1P52907 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA1P52907 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA1P52907 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA1P52907 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPZA1P52907 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA1P52907 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA1P52907 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA1P52907 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA1P52907 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA1P52907 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPZA1P52907 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA1P52907 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA1P52907 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA1P52907 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA1P52907 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA1P52907 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA1P52907 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPZA1P52907 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPZA1P52907 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPZA1P52907 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPZA1P52907 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CAPZA1P52907 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms