Protein–RNA interactions for Protein: P51805

PLXNA3, Plexin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA3P51805 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXNA3P51805 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLXNA3P51805 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA3P51805 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA3P51805 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PLXNA3P51805 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA3P51805 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA3P51805 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PLXNA3P51805 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLXNA3P51805 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLXNA3P51805 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PLXNA3P51805 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA3P51805 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA3P51805 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA3P51805 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA3P51805 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA3P51805 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA3P51805 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PLXNA3P51805 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms