Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCN5P51795 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLCN5P51795 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLCN5P51795 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLCN5P51795 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms