Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR5P51681 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR5P51681 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR5P51681 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR5P51681 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR5P51681 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR5P51681 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR5P51681 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR5P51681 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR5P51681 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR5P51681 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR5P51681 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR5P51681 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR5P51681 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR5P51681 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR5P51681 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR5P51681 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR5P51681 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR5P51681 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR5P51681 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR5P51681 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR5P51681 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR5P51681 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR5P51681 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR5P51681 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR5P51681 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR5P51681 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR5P51681 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR5P51681 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR5P51681 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR5P51681 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR5P51681 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR5P51681 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR5P51681 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR5P51681 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR5P51681 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR5P51681 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR5P51681 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR5P51681 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR5P51681 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR5P51681 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR5P51681 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR5P51681 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR5P51681 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR5P51681 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR5P51681 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCR5P51681 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR5P51681 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR5P51681 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR5P51681 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR5P51681 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR5P51681 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR5P51681 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR5P51681 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR5P51681 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR5P51681 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR5P51681 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR5P51681 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR5P51681 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR5P51681 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR5P51681 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR5P51681 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR5P51681 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR5P51681 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR5P51681 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR5P51681 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCR5P51681 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR5P51681 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR5P51681 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR5P51681 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCR5P51681 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR5P51681 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR5P51681 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR5P51681 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR5P51681 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCR5P51681 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR5P51681 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR5P51681 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR5P51681 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR5P51681 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCR5P51681 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR5P51681 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR5P51681 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR5P51681 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCR5P51681 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR5P51681 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR5P51681 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR5P51681 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR5P51681 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR5P51681 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR5P51681 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR5P51681 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR5P51681 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCR5P51681 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR5P51681 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR5P51681 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR5P51681 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCR5P51681 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCR5P51681 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCR5P51681 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms