Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCNN1BP51168 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCNN1BP51168 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCNN1BP51168 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCNN1BP51168 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms