Protein–RNA interactions for Protein: P50993

ATP1A2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A2P50993 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATP1A2P50993 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP1A2P50993 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP1A2P50993 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A2P50993 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms